美籍华人申请中国旅游签证,一个罕见的问题

大家好，我这2-3周因为家庭的问题，急需回国一趟。但是我面临了一个问题：
去年的暑假，我回国了一趟，我那时候刚刚入籍，我耍了个小聪明， 我持美国护照，从香港入境，然后买去北京的飞机票。在北京入境的时候，我用的是中国护照。一切顺利。
当我从北京离开的时候，问题来了。因为我计划从北京飞香港，然后从香港回美国。我在边检的时候，出示美国护照，他们说我上面没有中国签证，不能让我走（不知道当时我出示中国的护照，会怎么样）
结果，我办了一个港澳通行证，进入了香港，然后从香港回美国。
现在，我学乖了，想正规的申请中国签证回国。可是申请签证需要中国护照原件。原件上有我在北京入境的盖章，却没有离境的盖章。如果他们发现了，会拒签吗？美籍华人第一次申请中国签证，为什么要提供中国护照原件呢？
我很需要大家的帮忙，email: tzhao07@yahoo.com 先谢了

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